MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 plasmid pP880101

Total Repeats: 742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011721	TTTG	2	8	185	192	0 %	75 %	25 %	0 %	218203845
2	NC_011721	GAG	2	6	251	256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203845
3	NC_011721	GGA	2	6	284	289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203845
4	NC_011721	GAT	3	9	331	339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203845
5	NC_011721	AAG	2	6	411	416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203845
6	NC_011721	ATA	2	6	485	490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203845
7	NC_011721	TAA	2	6	567	572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203846
8	NC_011721	TGT	2	6	583	588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203846
9	NC_011721	GT	3	6	610	615	0 %	50 %	50 %	0 %	218203846
10	NC_011721	CA	3	6	623	628	50 %	0 %	0 %	50 %	218203846
11	NC_011721	ATA	2	6	672	677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203846
12	NC_011721	AGG	2	6	745	750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203846
13	NC_011721	AAG	2	6	771	776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203846
14	NC_011721	CAGT	2	8	831	838	25 %	25 %	25 %	25 %	218203846
15	NC_011721	CTC	2	6	870	875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203846
16	NC_011721	TTA	2	6	886	891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203846
17	NC_011721	ATTTT	2	10	1212	1221	20 %	80 %	0 %	0 %	218203847
18	NC_011721	T	9	9	1218	1226	0 %	100 %	0 %	0 %	218203847
19	NC_011721	AAC	2	6	1246	1251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203847
20	NC_011721	A	6	6	1272	1277	100 %	0 %	0 %	0 %	218203847
21	NC_011721	ATT	2	6	1287	1292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203847
22	NC_011721	TC	3	6	1296	1301	0 %	50 %	0 %	50 %	218203847
23	NC_011721	AG	3	6	1351	1356	50 %	0 %	50 %	0 %	218203847
24	NC_011721	TTC	2	6	1378	1383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203847
25	NC_011721	TAA	2	6	1431	1436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203847
26	NC_011721	ATA	2	6	1455	1460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203847
27	NC_011721	GGAT	2	8	1461	1468	25 %	25 %	50 %	0 %	218203847
28	NC_011721	A	6	6	1561	1566	100 %	0 %	0 %	0 %	218203847
29	NC_011721	ACA	2	6	1609	1614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203847
30	NC_011721	CTC	2	6	1739	1744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203848
31	NC_011721	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	218203848
32	NC_011721	TAA	2	6	1896	1901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203848
33	NC_011721	ATA	2	6	1994	1999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203848
34	NC_011721	TTA	2	6	2018	2023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203848
35	NC_011721	TTGA	2	8	2035	2042	25 %	50 %	25 %	0 %	218203848
36	NC_011721	AG	3	6	2067	2072	50 %	0 %	50 %	0 %	218203848
37	NC_011721	T	6	6	2091	2096	0 %	100 %	0 %	0 %	218203848
38	NC_011721	CAAG	2	8	2111	2118	50 %	0 %	25 %	25 %	218203848
39	NC_011721	ATA	2	6	2225	2230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203848
40	NC_011721	TGAT	2	8	2243	2250	25 %	50 %	25 %	0 %	218203848
41	NC_011721	TTTTA	2	10	2265	2274	20 %	80 %	0 %	0 %	218203848
42	NC_011721	TGA	2	6	2280	2285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203848
43	NC_011721	ATA	2	6	2384	2389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203848
44	NC_011721	TCAA	2	8	2405	2412	50 %	25 %	0 %	25 %	218203848
45	NC_011721	TTA	2	6	2432	2437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203848
46	NC_011721	A	8	8	2456	2463	100 %	0 %	0 %	0 %	218203848
47	NC_011721	TC	3	6	2469	2474	0 %	50 %	0 %	50 %	218203848
48	NC_011721	ATA	2	6	2480	2485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203848
49	NC_011721	AAT	2	6	2679	2684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203848
50	NC_011721	TTA	2	6	2692	2697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203848
51	NC_011721	A	7	7	3076	3082	100 %	0 %	0 %	0 %	218203849
52	NC_011721	TAT	2	6	3083	3088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203849
53	NC_011721	TCA	2	6	3092	3097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203849
54	NC_011721	TCT	2	6	3269	3274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203849
55	NC_011721	GAA	2	6	3402	3407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203849
56	NC_011721	GAT	2	6	3417	3422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203849
57	NC_011721	CCA	2	6	3424	3429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218203849
58	NC_011721	ATT	2	6	3434	3439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203849
59	NC_011721	GCC	2	6	3459	3464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218203849
60	NC_011721	TAT	2	6	3487	3492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203849
61	NC_011721	TGA	2	6	3611	3616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203849
62	NC_011721	CAA	2	6	3669	3674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203849
63	NC_011721	CAAC	2	8	3686	3693	50 %	0 %	0 %	50 %	218203849
64	NC_011721	GAG	2	6	3706	3711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203849
65	NC_011721	CGC	2	6	3808	3813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218203849
66	NC_011721	AAG	2	6	3934	3939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203849
67	NC_011721	CAA	2	6	4155	4160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203849
68	NC_011721	GAA	2	6	4209	4214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203849
69	NC_011721	TTA	2	6	4245	4250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203849
70	NC_011721	TTTG	2	8	4280	4287	0 %	75 %	25 %	0 %	218203849
71	NC_011721	TGG	2	6	4309	4314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218203849
72	NC_011721	A	7	7	4366	4372	100 %	0 %	0 %	0 %	218203849
73	NC_011721	AAC	2	6	4378	4383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203849
74	NC_011721	TCC	2	6	4475	4480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203849
75	NC_011721	CTT	2	6	4498	4503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203849
76	NC_011721	GCTAC	2	10	4506	4515	20 %	20 %	20 %	40 %	218203849
77	NC_011721	TTG	2	6	4632	4637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203849
78	NC_011721	AGA	2	6	4649	4654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203849
79	NC_011721	AAC	2	6	4655	4660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203849
80	NC_011721	AGA	2	6	4751	4756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203849
81	NC_011721	AGA	2	6	4759	4764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203849
82	NC_011721	C	6	6	4773	4778	0 %	0 %	0 %	100 %	218203849
83	NC_011721	C	6	6	4781	4786	0 %	0 %	0 %	100 %	218203849
84	NC_011721	C	6	6	4789	4794	0 %	0 %	0 %	100 %	218203849
85	NC_011721	C	7	7	4797	4803	0 %	0 %	0 %	100 %	218203849
86	NC_011721	C	7	7	4813	4819	0 %	0 %	0 %	100 %	218203849
87	NC_011721	ACAGT	2	10	4838	4847	40 %	20 %	20 %	20 %	218203849
88	NC_011721	CAT	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203849
89	NC_011721	C	6	6	4926	4931	0 %	0 %	0 %	100 %	218203849
90	NC_011721	AAC	2	6	4990	4995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203849
91	NC_011721	AAC	2	6	5016	5021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203849
92	NC_011721	G	6	6	5079	5084	0 %	0 %	100 %	0 %	218203849
93	NC_011721	TAT	2	6	5153	5158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203849
94	NC_011721	ACC	2	6	5163	5168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218203849
95	NC_011721	ATTG	2	8	5201	5208	25 %	50 %	25 %	0 %	218203849
96	NC_011721	T	6	6	5265	5270	0 %	100 %	0 %	0 %	218203849
97	NC_011721	T	6	6	5374	5379	0 %	100 %	0 %	0 %	218203850
98	NC_011721	T	6	6	5384	5389	0 %	100 %	0 %	0 %	218203850
99	NC_011721	GCA	2	6	5450	5455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203850
100	NC_011721	TGTC	2	8	5457	5464	0 %	50 %	25 %	25 %	218203850
101	NC_011721	CT	3	6	5503	5508	0 %	50 %	0 %	50 %	218203850
102	NC_011721	A	6	6	5533	5538	100 %	0 %	0 %	0 %	218203850
103	NC_011721	A	7	7	5598	5604	100 %	0 %	0 %	0 %	218203850
104	NC_011721	GCA	2	6	5620	5625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203850
105	NC_011721	GTCT	2	8	5626	5633	0 %	50 %	25 %	25 %	218203850
106	NC_011721	TAT	2	6	5744	5749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203850
107	NC_011721	ACG	2	6	5768	5773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203850
108	NC_011721	A	6	6	5823	5828	100 %	0 %	0 %	0 %	218203850
109	NC_011721	CCT	2	6	5882	5887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203850
110	NC_011721	A	7	7	6036	6042	100 %	0 %	0 %	0 %	218203850
111	NC_011721	AGC	2	6	6062	6067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203850
112	NC_011721	CTGT	2	8	6093	6100	0 %	50 %	25 %	25 %	218203850
113	NC_011721	CAGGA	2	10	6115	6124	40 %	0 %	40 %	20 %	218203850
114	NC_011721	ATT	2	6	6183	6188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203850
115	NC_011721	AAG	4	12	6193	6204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203850
116	NC_011721	TTA	2	6	6243	6248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203850
117	NC_011721	TTAA	2	8	6255	6262	50 %	50 %	0 %	0 %	218203850
118	NC_011721	TAT	2	6	6297	6302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203850
119	NC_011721	CAA	2	6	6333	6338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203850
120	NC_011721	ATT	2	6	6433	6438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203850
121	NC_011721	TAA	2	6	6458	6463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203850
122	NC_011721	CTG	2	6	6549	6554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203851
123	NC_011721	TCTA	2	8	6591	6598	25 %	50 %	0 %	25 %	218203851
124	NC_011721	TGGC	2	8	6625	6632	0 %	25 %	50 %	25 %	218203851
125	NC_011721	TCA	2	6	6654	6659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203851
126	NC_011721	GTC	2	6	6660	6665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203851
127	NC_011721	TCAA	2	8	6681	6688	50 %	25 %	0 %	25 %	218203851
128	NC_011721	AAG	2	6	6720	6725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203851
129	NC_011721	TAT	2	6	6825	6830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203851
130	NC_011721	GTGA	2	8	6854	6861	25 %	25 %	50 %	0 %	218203851
131	NC_011721	ATT	2	6	6909	6914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203851
132	NC_011721	ACC	2	6	6968	6973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218203851
133	NC_011721	GGCG	2	8	7006	7013	0 %	0 %	75 %	25 %	218203851
134	NC_011721	CGATCT	2	12	7051	7062	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218203851
135	NC_011721	C	6	6	7124	7129	0 %	0 %	0 %	100 %	218203851
136	NC_011721	TGGC	2	8	7240	7247	0 %	25 %	50 %	25 %	218203851
137	NC_011721	GCAG	2	8	7324	7331	25 %	0 %	50 %	25 %	218203851
138	NC_011721	GTT	2	6	7376	7381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203851
139	NC_011721	TCC	2	6	7403	7408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203851
140	NC_011721	T	6	6	7416	7421	0 %	100 %	0 %	0 %	218203851
141	NC_011721	TTC	2	6	7516	7521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203851
142	NC_011721	TAA	2	6	7609	7614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203851
143	NC_011721	A	6	6	8887	8892	100 %	0 %	0 %	0 %	218203852
144	NC_011721	GGAT	2	8	8964	8971	25 %	25 %	50 %	0 %	218203852
145	NC_011721	CTC	2	6	8974	8979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203852
146	NC_011721	TA	3	6	8988	8993	50 %	50 %	0 %	0 %	218203852
147	NC_011721	TAT	2	6	9033	9038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203852
148	NC_011721	CAT	2	6	9049	9054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203852
149	NC_011721	TAA	2	6	9074	9079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203852
150	NC_011721	A	6	6	9078	9083	100 %	0 %	0 %	0 %	218203852
151	NC_011721	TTA	2	6	9154	9159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203852
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153	NC_011721	TGA	2	6	9230	9235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203852
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155	NC_011721	CAG	2	6	9585	9590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203853
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159	NC_011721	CCT	2	6	9709	9714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203854
160	NC_011721	TAT	2	6	9732	9737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203854
161	NC_011721	TAA	2	6	9777	9782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203854
162	NC_011721	TTG	2	6	9801	9806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203854
163	NC_011721	A	6	6	9840	9845	100 %	0 %	0 %	0 %	218203854
164	NC_011721	TAT	2	6	9923	9928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203854
165	NC_011721	TGA	2	6	10081	10086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203854
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168	NC_011721	TCAT	2	8	10126	10133	25 %	50 %	0 %	25 %	218203854
169	NC_011721	TGTTTC	2	12	10197	10208	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	218203854
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171	NC_011721	T	6	6	10536	10541	0 %	100 %	0 %	0 %	218203855
172	NC_011721	TAAG	2	8	10550	10557	50 %	25 %	25 %	0 %	218203855
173	NC_011721	AGTA	2	8	10643	10650	50 %	25 %	25 %	0 %	218203855
174	NC_011721	TTC	2	6	10686	10691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203855
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185	NC_011721	ATT	2	6	11110	11115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203855
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257	NC_011721	A	7	7	14546	14552	100 %	0 %	0 %	0 %	218203860
258	NC_011721	AGA	2	6	14606	14611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203860
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263	NC_011721	TA	3	6	14869	14874	50 %	50 %	0 %	0 %	218203860
264	NC_011721	AGA	2	6	14905	14910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203860
265	NC_011721	TTGT	2	8	14974	14981	0 %	75 %	25 %	0 %	218203860
266	NC_011721	GA	3	6	15384	15389	50 %	0 %	50 %	0 %	218203861
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268	NC_011721	TCA	2	6	15502	15507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203861
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272	NC_011721	TTTG	2	8	15614	15621	0 %	75 %	25 %	0 %	218203861
273	NC_011721	AAT	2	6	15633	15638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203861
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402	NC_011721	TGA	2	6	26061	26066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203875
403	NC_011721	T	6	6	26259	26264	0 %	100 %	0 %	0 %	218203876
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